A etapa configurativa tem como objetivo ajudar o seminarista a se configurar e a se enraizar na fisionomia do Cristo, Bom Pastor.

Nesse processo, inicia-se também os estudos teológicos que são imprescindíveis para a vida presbiteral. Segundo a Ratio Fundamentalis, “os seminaristas são chamados a realizarem uma fecunda e harmônica interação entre a maturidade humana e espiritual, e entre a vida de oração e aprendizagem teológica” (nº 70).

Aqui também, são chamados a adquirirem a espiritualidade do Padre diocesano, caracterizada pela doação e serviço aos irmãos e irmãs, e sempre em comunhão com o seu Bispo diocesano e o clero.